Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MCAMP43121 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MCAMP43121 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCAMP43121 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCAMP43121 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCAMP43121 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms