Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGP37231 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGP37231 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPARGP37231 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms