Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
GZMBP10144 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GZMBP10144 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GZMBP10144 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GZMBP10144 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
GZMBP10144 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GZMBP10144 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GZMBP10144 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GZMBP10144 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms