Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOA4P06727 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOA4P06727 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms