Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CREB3O43889 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms