Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NEMP2A6NFY4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms