Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL33A6NCF5 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL33A6NCF5 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms