Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms