Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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AMBRA1Q9C0C7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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AMBRA1Q9C0C7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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AMBRA1Q9C0C7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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