Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXP3Q9BZS1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms