Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VAMP8Q9BV40 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms