Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRIQ1Q96JM4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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