Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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