Protein–RNA interactions for Protein: Q8N945

PRELID2, PRELI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID2Q8N945 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID2Q8N945 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms