Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST2

ZCCHC23, Zinc finger CCHC domain-containing protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC23Q6ZST2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZCCHC23Q6ZST2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms