Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms