Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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