Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTRK3Q16288 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NTRK3Q16288 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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