Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms