Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT88Q13099 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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