Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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GRIK2Q13002 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GRIK2Q13002 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GRIK2Q13002 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GRIK2Q13002 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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GRIK2Q13002 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIK2Q13002 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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