Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
STX4Q12846 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
STX4Q12846 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
STX4Q12846 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
STX4Q12846 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
STX4Q12846 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
STX4Q12846 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
STX4Q12846 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
STX4Q12846 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
STX4Q12846 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
STX4Q12846 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms