Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GRIN1Q05586 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms