Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERVK_113P63132 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms