Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARCN1P48444 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms