Protein–RNA interactions for Protein: P30039

PBLD, Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBLDP30039 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PBLDP30039 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBLDP30039 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBLDP30039 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBLDP30039 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBLDP30039 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBLDP30039 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBLDP30039 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBLDP30039 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PBLDP30039 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PBLDP30039 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PBLDP30039 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PBLDP30039 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PBLDP30039 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PBLDP30039 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PBLDP30039 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms