Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTKP29376 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTKP29376 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTKP29376 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTKP29376 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTKP29376 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTKP29376 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTKP29376 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LTKP29376 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LTKP29376 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms