Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EPHB2P29323 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHB2P29323 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms