Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CCNDBP1O95273 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCNDBP1O95273 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CCNDBP1O95273 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNDBP1O95273 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CCNDBP1O95273 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNDBP1O95273 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CCNDBP1O95273 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNDBP1O95273 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNDBP1O95273 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNDBP1O95273 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNDBP1O95273 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCNDBP1O95273 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CCNDBP1O95273 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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CCNDBP1O95273 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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CCNDBP1O95273 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNDBP1O95273 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNDBP1O95273 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNDBP1O95273 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNDBP1O95273 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNDBP1O95273 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNDBP1O95273 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNDBP1O95273 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNDBP1O95273 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNDBP1O95273 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNDBP1O95273 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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