Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EBAG9O00559 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms