Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMGB1P1B2RPK0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms