Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TRAPPC1Q9Y5R8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms