Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGSF9BQ9UPX0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms