Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MCMBPQ9BTE3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms