Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms