Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM47Q96LD4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM47Q96LD4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms