Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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