Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms