Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBAP2Q5T6F2 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UBAP2Q5T6F2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms