Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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ALX1Q15699 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALX1Q15699 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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