Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IRF4Q15306 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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