Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GTF2H3Q13889 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GTF2H3Q13889 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GTF2H3Q13889 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GTF2H3Q13889 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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GTF2H3Q13889 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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GTF2H3Q13889 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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GTF2H3Q13889 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H3Q13889 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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