Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1SQ13698 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1SQ13698 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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