Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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