Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF85Q03923 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms