Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F1Q01094 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E2F1Q01094 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E2F1Q01094 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms