Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB1P82279 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB1P82279 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB1P82279 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB1P82279 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB1P82279 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB1P82279 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB1P82279 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB1P82279 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB1P82279 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB1P82279 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB1P82279 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms