Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAE1P78406 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAE1P78406 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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