Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PGGT1BP53609 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP53609 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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