Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERFP50548 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERFP50548 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERFP50548 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERFP50548 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERFP50548 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERFP50548 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERFP50548 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERFP50548 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERFP50548 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERFP50548 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERFP50548 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERFP50548 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ERFP50548 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ERFP50548 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ERFP50548 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms